云南省醫師協會于2004年9月24日成立，是經云南省民政廳登記注冊，由執業醫師、執業助理醫師及團體會員單位自愿組成的全省性、行業性、非營利性的群眾團體，是省一級協會和獨立的法人社團。現任會長是原云南省衛生計生委巡視員徐和平，楊萬澤副會長兼任秘書長。

協會現有團體會員單位194家，個人會員近萬人，專科醫師分會和專委會94個。協會是省民政評定的“5A級行業協會”；是省科協評定的“一級學會”和“優秀學會”；是中國科協連續三年（2016、2017、2018）評為的“全國科普日優秀活動及組織單位”；是“中國醫師協會以嶺關愛醫師健康專項基金優秀執行團隊”；是中國醫師協會評為的“優秀地方醫師協會”。

云南省醫師協會作為全省醫生的行業組織，在云南省衛健委和云南省民間組織管理局的領導下，在省科協和中國醫師協會的指導下，始終堅持“服務、協調、自律、維權、監督、管理”的辦會宗旨，圍繞黨和政府的中心工作，致力于加強我省醫師行業的規范和管理、醫師的教育培訓以及醫師隊伍的自律與合法權益的維護這三大主要任務開展工作。

通過加強自身建設包括黨建工作，發展專科醫師分會；協助省級衛生行政開展全省醫師的定期考核、住院醫師的規范化培訓、專科醫師的培訓工作；開展醫師的繼續教育和學術交流；與國際應急管理學會醫學專業委員會合作，為云南省醫護人員出國（境）研修，培養我省與國際接軌的醫學高端人才做好服務；發揮協會專家人才優勢，組織健康教育科普宣傳工作，為云南人民的健康和社會主義建設服務；組織專家到州、市開展人文醫學培訓、健康講座、公益活動；聯合企業單位向住院貧困患者捐款；關愛醫師、慰問臨床一線受到傷害的醫師，維護醫師的合法權益，為他們提供有益的幫助和服務；大力培訓基層醫師，舉辦國家級、省級繼續教育項目和國際國內學術活動；大力宣傳、表彰獎勵優秀醫師和先進集體，推薦和評選“中國醫師獎”、“云南醫師獎”等工作；結合國家“一帶一路”倡議，與云南電視臺國際頻道共同開辦健康資訊欄目《名醫開講》、《健康Info.》，多形式、多角度報道醫療行業重大活動、健康扶貧項目、涉外特色項目、養生健身及其他綠色康養內容，如全民營養周專題、世界無煙日專題、兒童白血病專題、阿爾茲海默癥專題、防暑降溫專題等，開展健康科普知識宣傳，服務于包括周邊國家的百姓等工作，為推進我省醫師行業高素質人才隊伍的建設，健康中國、健康云南的建設做了大量的工作。